Почистить сервер от вирусов

От недавнего времени на моих сайтах, которые расположены на одном и том же VPS сервере начал гулять вирус, то один сайт яндекс заблокирует, то другой из-за вируса. Только удалю код с сайта, как он снова появляется но на другом сайте!

Переустанавливать сервер нет никакого желания, т.к. это очень много мороки, да и хотелось бы на будущее понять, как решать данную проблему. Пробовал найти сам вирус - ничего, антивирус linux-совский тоже ничего не показал.